|
Õppetoolid
Teadus
Lõputööd
Tudengile
Instituudist
Bioloogilise ohutuse Eesti projekt
![]() |
Geenitehnoloogia õppetoolKoosseis: Erkki Truve, PhD, professor, õppetooli juhataja erkki.truve@ttu.ee Kadri Järve, PhD, dotsent, kadri.jarve@ttu.ee Cecilia Sarmiento, PhD, dotsent, cecilia.sarmiento@ttu.ee Tamara Enno, DSc, vanemteadur, tamara.enno@ttu.ee Heiti Paves, PhD, vanemteadur, heiti.paves@ttu.ee Hilma Peuša, PhD, vanemteadur hilma.peusa@ttu.ee Ljudmilla Timofejeva, PhD, vanemteadur, ljuda_timofejeva@yahoo.com Irena Jakobson, teadur, irena.jakobson@ttu.ee Eve-Ly Ojangu, teadur, eve-ly.ojangu@ttu.ee Allan Olspert, teadur, allan.olspert@ttu.ee Merike Sõmera, teadur (lapsepuhkusel), merike.meier@ttu.ee Jelena Tsõmbalova, teadur jelena.tsombalova@ttu.ee Lenne Nigul, assistent, lenne.nigul@ttu.ee Üllar Rammul, assistent, yllar.rammul@ttu.ee Signe Nõu, insener, signenou@hotmail.com Galina Sokolova vanemlaborant Birger Ilau, doktorant, birger.ilau@ttu.ee Kristel Järve, doktorant, kristel.jarve@ttu.ee Diana Posti, doktorant, diana.di@mail.ee Gabriela Uffert, doktorant gabrielala@hot.ee Kristjan Kamsol, magistrant, XXsajandilaps@gmail.com Mariliis Kiisma, magistrant, mariliis.kiisma@ttu.ee Kairi Kärblane, magistrant, kairi.karblane@mail.ee Kristiina Talts, magistrant, krezzu@gmail.com Krista Tanner, üliõpilane, tanner277@hotmail.com Karmen Tõnismann, üliõpilane, karmen1755@hot.ee
ProjektidTaimeviirused ja RNA vaigistamine Projekti juht: prof. E. Truve ![]() Projekti üldised eesmärgid on: 1) taimede RNA viiruste hulka kuuluvate sobemoviiruste genoomi organisatsiooni, ekspressiooni ning individuaalsete geenide funktsioonide uurimine; 2) viirusvastase RNA vaigistamise ning seda supresseerivate viirusvalkude (muuhulgas sobemoviiruste valkude) uurimine. Sobemoviiruste molekulaarsel iseloomustamisel kasutame mudelobjektina otra, kaera ja keraheina nakatavat keraheina laiguviirust (Cocksfoot mottle virus, CfMV). Kasutades viiruse infektsioonilist cDNA-d ja sellel baseeuvaid erinevaid konstrukte, iseloomustame individuaalsete viirusvalkude bioloogilisi funktsioone ning ekspressiooni strateegiaid. Analüüsime viirus genoomse RNA signaaljärjestusi, mis on olulised viiruse replikatsioonil ning rekombinatsioonil. Teise eesmärgi realiseerimisel iseloomustame me RNA vaigistamise supressoreid samuti eelkõige viiruste perekonnast Sobemovirus, aga ka teiste viiruste poolt kodeeritavaid. Uurime ka nimetatud suppressorite muid funktsioone viiruse elutsüklis ja supressoritega inerakteeruvaid peremehe valke. Taimede (eelkõige Arabidopsis’e) endogeensete valkude uurimisel identifitseerime ja iseloomustame ka uudseid endogeenseid RNA vaigistamise supressoreid. Siin on meie peamiseks uurimisobjektiks ABC valkude superperekonda kuuluvad valgud AtRLI1 ja AtRLI2. Tööd finantseerivad hetkel Eesti Vabariigi Haridus- ja Teadusministeerium ning Eesti Teadusfond. Publikatsioonid 2002-2006: 1. Sarmiento, C., Gomez, E., Meier, M., Kavanagh, T., Truve, E. 2006. Cocksfoot mottle virus P1 suppresses RNA silencing in Nicotiana benthamiana and Nicotiana tabacum. Virus Res., in press. 2. Meier, M., Truve, E. 2006. An attempt to identify recombinants between two sobemoviruses in doubly infected oat plants. Environ. Biosafety Res. 5: in press. 3. Meier, M., Paves, H., Olspert, A., Tamm, T., Truve, E. 2006. P1 protein of Cocksfoot mottle virus is indispensable for the systemic spread of the virus. Virus Genes 32:321-326. 4. Sarmiento, C., Nigul, L., Kazantseva, J., Buschmann, M., Truve, E. 2006. AtRLI2 is an endogenous suppressor of RNA silencing. Plant Mol. Biol. 61:153-163. 5. Truve, E. 2004. Genus: Sobemovirus. In: Viruses and Virus Diseases of Poaceae (Gramineae). Lapierre H., Signoret P.A., eds. INRA Editions, Paris. 418-422. 6. Nigul, L., Olspert, A., Meier, M., Paves, H., Talpsep, T., Truve, E. 2004. New plant vectors for protein tagging with E2 epitope. Plant Mol. Biol. Rep. 22:399-407. 7. Tiidema, A., Truve, E. 2004. Efficient regeneration of fertile barley plants from callus cultures of several Nordic cultivars. Hereditas 140:171-176. Eesmärgiks on välja selgitada müosiinide funktsioonid taimerakkudes: rakusiseses- ja rakkudevahelises transpordis ning morfogeneesis. 1. Iseloomustada ja publitseerida klass XI müosiini XI-K geeni ekspressioon ning vastava T-DNA insertsiooniliste mutantide fenotüüp detailselt. 2. Jätkata teiste klass VIII ja XI müosiinide geenide uurimist ning nende T-DNA insertsiooniliste mutantide fenotüpiseerimist. Mudelsüsteemina kasutatakse Arabidopsis thaliana’t (müürlook) ja uurimismeetoditeks on: 1. Müosiinide insertsiooniliste T-DNA mutantide analüüs; 2. Müosiinide koe- ja arenguspetsiifilise ekspressiooni uurimine; 3. GFP ja müosiinide hübriidvalkude ekspresseerimine. Töörühma liikmed:Eve-Ly Ojangu, MSc, doktorant, eve-ly.ojangu@ttu.ee Birger Ilau, MSc, doktorant, birger5@yahoo.com Kristel Järve, MSc, doktorant, kessuks@hot.ee
|
|
Geenitehnoloogia instituut Akadeemia tee 15, 12618 Tallinn tel 620 4400, faks 620 4401, yt@ttu.ee | |